John E. Walker er en britisk kemiker, uddannet i Oxford og siden 1974 ansat ved universitetet i Cambridge. Han opklarede strukturen af enzymet ATPsyntase, som danner ATP, cellens energimolekyle. I 1997 modtog han nobelprisen i kemi sammen med den danske læge og fysiolog Jens Chr. Skou og den amerikanske biokemiker Paul Boyer for deres forskning i ATP-dannende og -nedbrydende enzymer.