Obaku-zen er den tredje, sidste og mindste gren af zenbuddhismen i Japan. De to andre er Soto-zen og Rinzai-zen. Retningen blev grundlagt af den kinesiske munk Yinyuan (japansk navn Ingen) i 1654 og har sit hovedsæde i Mampuku-ji i Uji, tæt ved Kyoto. Hovedtemplet holder fast ved, at det officielle sprog er kinesisk. Karakteristisk for kinesisk buddhisme, som ikke har en skarp opdeling mellem zen- og shinbuddhisme, benyttes nianfo (japansk nembutsu) som meditationsredskab.